Nature导读(02 November 2017 VOL 551 Number 7678)
发布人:wuph 发布时间:2017/12/19 10:45:34  浏览次数:1414次
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Nature

02 November 2017 VOL 551  Number 7678

 

评论                                      

  1. 观察海洋冰川的卫星将退役                   Alexandra Witze 13–14
  2. 德国的杰出科研资助计划受到质疑               Quirin Schiermeier   15
  3. 环境对精神疾病的影响                          Sara Reardon 15–16
  4. 美国的科学游行计划受到抨击                   Emma Marris 16–17
  5. 早期肿瘤的测序研究                              Heidi Ledford  18

 

研究

新闻

  1. 引力波:引力波探测的故事              M. Coleman Miller  36–37
  2. 生物化学:麦硫因的合成                 Mark W. Ruszczycky  37–38
  3. 染色体生物学:如何构建3D基因组?   Rachel Patton McCord  38–40
  4. 理论物理学:夸克在核聚变中的作用       Gerald A. Miller  40–41
  5. 神经生物学: 施旺细胞在神经修复中的作用   Robert H. Miller  41–42
  6. 分子进化学:6万代大肠杆菌的进化历程     Joshua B. Plotkin  42–43

 

论著

  1. 超过 6 万代的大肠杆菌分子进化动态 Benjamin H. Good 45–50

 直接观察进化过程中种群基因组在长时间的动态变化十分困难。本研究利用全基因组宏基因组测序以500代为间隔分析了超过6万代、12个实验室大肠杆菌种群的分子进化动态。发现在每个种群中同时出现多种快速适应的有益变异,在大多数种群内自发出现了长期准稳态的进化分支共存,以及自然选择的靶向基因的持续改变。这一发现揭开了一个复杂且多变的对于不变环境的长期适应过程。

  1. 通过去除凝集素发现两种独立的染色质组织模式  Wibke Schwarzer  51–56

 细胞核中染色质组织成多层级结构,形成不同活性区域,从而影响基因组功能。本研究发现敲除小鼠肝脏中的凝集素装载因子Nipbl导致染色体折叠发生重组。亚兆碱基结构域(TAD)整体消失,但区室分隔得以保留甚至加强,更加精确地反应出表观遗传景观。这揭示了基因组的三维结构是两种独立机制共同作用的结果:不依赖凝集素、更加精细的基因组区室分离以及凝集素依赖的TAD形成。

  1. 海洋红藻的光能捕捉元件——藻胆体的结构Jun Zhang 57–63

 

短篇报导

  1. 双中子星合并后新千星的可见光辐射                Iair Arcavi  64–66

 本研究在可见光到近红外波段,探测到与双中子星合并后产生的引力波信号、低亮度短时γ射线暴对应的暂现。理论预言这是千新星的辐射。观测显示,辐射迅速红移并变暗。数值模拟得出的结论是,观测数据与0.01个太阳的喷射物(形成的千新星)的光变曲线大体一致。

  1. 双中子星合并中r-过程核合成的光谱鉴定               E. Pian  67–70
  2. 引力波事件GW170817的X射线对应体          E. Troja  71–74
  3. 千新星是引力波源的电磁对应体                S. J. Smartt  75–79
  4. 双中子星合并中的重元素起源                 Daniel Kasen  80–84   
  5. 利用引力波精确测量哈勃常数 The LIGO Scientific Collaboration 85–88
  6. 双重重子的夸克层次类核聚变反应               Marek Karliner  89–91
  7. 基因组相关分析发现65个新的乳腺癌风险位点  Kyriaki Michailidou 92–94 
  8. 单细胞RNA测序揭示恶性疟原虫中性裂殖子-雌雄配子体分化的表观遗传调控元件                                          Asaf Poran 95–99

摘要:恶性疟原虫的裂殖子在人体红细胞内通过无性生殖形成中性裂殖子,在约1-30%裂殖子内,ap2-g基因被激活,促使裂殖子分化为雌雄配子体,可在蚊子体内进行有性繁殖。由于一个群体中只有部分疟原虫激活ap2-g,导致传统的RNA-seq方法无法进行分析。本研究利用单细胞RNA测序技术,对AP2-G 敲除系与NF54野生型疟原虫进行RNA测序,发现AP2-G+成熟裂殖体内某些调控元件表达特异性上调,包括其他AP2转录元件、组蛋白修饰酶和核小体定位调控元件。本研究表明,表观遗传调控元件的表达可能在配子体发育中是必须的。

  1. 单细胞转录组学揭示从成纤维细胞到心肌细胞重编程背后细胞命运的转变过程                                           Ziqing Liu  100–104

 直接的细胞谱系转换技术(Direct lineage conversion)为组织再生和疾病模型建立提供了新策略。本文报导,利用单细胞RNA测序技术分析成纤维细胞-心肌细胞重编程过程中的全基因表达变化,发现mRNA处理和剪接相关元件的表达下调,其中剪接元件Ptbp1是成纤维细胞获得心肌细胞特异性剪接模式的一大障碍。同时,通过定量分析也发现了一系列心肌细胞富集的表面标记。

  1. 解除SKI–SMAD4介导的抑制作用是TH17细胞分化必需的

 Song Zhang 105–109

  1. IL-1R8是NK细胞中调节抗肿瘤和抗病毒活性的检查点

 Martina Molgora  110–114

  1. 葡萄糖以循环的乳酸形式间接进入TCA循环  Sheng Hui 115–118

 此前认为在哺乳动物中葡萄糖在有氧条件下主要直接进入三羧酸(TCA)循环生成CO2,也可通过糖酵解代谢为乳酸来供给组织营养。本文报导,乳酸可作为TCA循环的主要碳来源与能量来源。通过给小鼠注射13C标记的营养物,发现乳酸的循环量是各种代谢物中最高的,在喂食和禁食小鼠体内,分别是葡萄糖的1.1倍和2.5倍;在禁食阶段,除了大脑外所有组织中葡萄糖都主要通过乳酸进入TCA循环;在经基因改造的肺与胰腺癌肿瘤内,TCA循环也更多利用乳酸而非葡萄糖。

  1. 全局资源分配策略控制大肠杆菌的增长转变动力学

 David W. Erickson  119–123

  1. 植物中先驱转录因子引起胚胎表观遗传的重激活      Zeng Tao 124–128

 

编辑推荐

乳腺癌的风险受到多种易感基因罕见编码变异以及非编码变异的影响。本期NATURE《Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci》(标题22)一文报道,通过对来自欧洲和东亚的患者和对照进行基因组相关性分析,发现65个新位点与乳腺癌风险显著相关。大量位点存在于远距离调控序列当中,可能参与调节乳腺癌相关基因。这些集中于转录因子结合位点的单核苷酸多态性可使乳腺癌遗传性增加2-5倍。这一发现有助于改善遗传风险评分在乳腺癌个体筛查及预防中的应用。


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