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贵阳市多家医院感染产ESBLs大肠埃希菌基因分型研究
陈云芬1, 董亚琼2, 余俊1, 陈芳1     
1. 550011 贵州,贵阳市第六医院呼吸科;
2. 550004 贵州,贵州医科大学附属医院呼吸科
[摘要] 目的 分析贵阳市多家医院临床分离的大肠埃希氏菌中产CTX-M-9型产超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum β-lactamase,ESBLs)的基因分型。方法 收集贵阳市多家医院临床分离的大肠埃希菌74株,经确证非重复产ESBLs大肠埃希菌47株,将已扩增的PCR产物进行基因测序并用NCBI数据库中的BLASTN比对测序结果,从而进行基因分型。结果 74株大肠埃希菌中检出47株产超广谱β-内酰胺酶。PCR扩增结果显示47株ESBLs基因阳性菌株中,33株携带CTX-M-9组基因。随机选取部分PCR扩增阳性产物进行DNA测序分析, 结果显示含CTX-M-9组基因阳性菌株的亚型为CTX-M-14型。结论 CTX-M-9型耐药基因为本研究产ESBLs大肠埃希菌主要基因,CTX-M-14型为其变异亚型。
[关键词] 大肠埃希菌     超广谱β内酰胺酶     CTX-M-9     基因分型    
Genotyping of extended spectrum beta lactamases of 33 Escherichia coli strains from several hospitals of Guiyang City
CHEN Yunfen1 , DONG Yaqiong2 , YU Jun1 , CHEN Fang1     
1. Department of Respiratory Diseases, the Sixth Hospital of Guiyang, Guiyang, Guizhou Province, 550011;
2. Department of Respiratory Diseases, Affiliated Hospital of Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou Province, 550004, China
Supported by the Project of Science and Technology of Guiyang Health and Family Planning Commission (2014-008)
Corresponding author: DONG Yaqiong, E-mail:dongyaqiong1971@qq.com
[Abstract] Objective To analyze the genotypes of CTX-M-9 producing extended spectrum β-lactamase (ESBLs)in Escherichia coli isolated from several hospitals in Guiyang City. Methods Among the 74 strains of isolated form several hospitals of Guiyang City, 47 strains were confirmed as non repetitive ESBLs producing. Then the amplified PCR products were sequenced, and the results were compared with the BLASTN sequencing results in the NCBI database for genotyping. Results In the 74 isolated strains of Escherichia coli, 47 strains were confirmed to produce ESBLs. PCR amplification showed that 33 of the 47 ESBLs positive strains carried CTX-M-9 group genes. For the randomly selected PCR positive samples, DNA sequencing results showed that the subtype of CTX-M-9 positive strains was CTX-M-14. Conclusion Drug resistance gene CTX-M-9 is the major gene in ESBLs producing Escherichia coli, and CTX-M-14 is its variant subtype.
[Key words] Escherichia coli     extended-spectrum β-lactamase     CTX-M-9     genotyping    

细菌耐药性问题已成为全球公共医疗卫生的难题,细菌产β内酰胺酶主要有AmpC酶、超广谱β内酰胺酶、耐酶抑制剂的β内酰胺酶和碳青霉烯酶等,其中超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum β-lactamase,ESBLs)是细菌产生耐药的重要机制和环节,ESBLs基因可通过质粒、转座子、插入序列等在菌株间水平传播。目前亚洲地区及中国流行的产ESBLs大肠埃希菌菌株仍以携带CTX-M型、TEM型、SHV型耐药基因为主。这3型中以CTX-M型占主导,并且有多个亚型发现,本研究针对CTX-M-9变异亚型进行基因序列分析,了解本市该基因型的特点。

1 资料与方法 1.1 菌株来源

74株大肠埃希菌分离自贵阳市多家医院2015年6月1日至2015年12月31日住院患者痰标本,培养按《全国临床检验操作规程》第4版要求进行[1],分离得到菌株接种于NC50复合板中拟行ESBLs表型筛选。质控菌株:大肠埃希菌ATCC25922、大肠埃希菌ATCC35218。

1.2 菌株鉴定及药敏试验

MicroScan-WalkAway-96-Plus微生物鉴定仪进行细菌鉴定及药敏分析,根据2014年版CLSI[2]推荐的标准微量肉汤稀释法测定产ESBLs大肠埃希菌对常用抗菌药物的最小抑菌浓度值。

1.3 PCR反应条件

基因型CTX-M-9,引物序列:上游:5′-TATTGGGAGT-TTGAGATGG-3′,下游:5′-TCCTTCAACTCAGCAAAAGT-3′,产物大小933 bp。PCR扩增的循环参数为94 ℃预变性5 min,94 ℃ 50 s,55 ℃ 45 s,72 ℃ 50 s,循环35次,最后72 ℃延伸6 min。

1.4 质量控制

琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物时设CTX-M-9标准产酶株为阳性对照,大肠埃希菌ATCC25922为阴性对照。

1.5 测序

随机选取部分PCR产物送大连宝生物有限公司纯化后进行DNA双向测序,测序结果用NCBI上的BLAST进行比对分析。

2 结果 2.1 产ESBLs大肠埃希菌耐药基因PCR检测分型结果

47株ESBLs基因阳性菌株中33株携带CTX-M-9组基因,产ESBLs大肠埃希菌耐药基因PCR电泳图谱见图 1

M:标准;1~13:临床标本;N:阴性对照;P:阳性对照 图 1 CTX-M-9型基因PCR扩增产物

2.2 PCR扩增产物测序结果

从痰液标本中随机选取CTX-M-9型耐药菌株10株;送大连宝生物有限公司纯化后进行DNA测序,并将测序结果与BLASTN比对,结果显示:CTX-M-9型耐药基因,基因亚型为CTX-M-14型(图 2)。

图 2 痰液标本CTX-M-9型基因PCR产物测序峰图

3 讨论

ESBLs存在于细菌中,由细菌丝氨酸蛋白酶衍生而来,可以水解抗菌药物(如广谱头孢菌素、大部分青霉素及单环类抗生素β内酰胺环),使抗菌药物失效,也可以通过质粒、转座子、插入序列等在菌株间水平传播,造成耐药菌株不断增长,从而导致ESBLs在医院的广泛流行。各个国家、地区、医院的环境因素及临床抗生素的使用剂量及频度不同致使ESBLs检出率、耐药性及基因型存在地区差异[3],本市产ESBLs大肠埃希菌以CTX-M为主,与我国其他地区报道一样[4-6],宁夏、天津、内蒙古等地区报道的CTX-M型基因所占比率分别为35.5%、67.9%、100%,本研究中47株产ESBLs大肠埃希菌中CTX-M型占93.62%,低于浙江温州地区报道数据(95.0%)及王喜仁等[7]研究数据(100%),反映不同地区、不同医院基因流行特点不同;47株基因阳性ESBLs大肠埃希菌中CTX-M-9型占70.2%,反映本市产ESBLs大肠埃希菌耐药基因流行特点,也说明CTX-M-9为本市产ESBLs大肠埃希菌的主要耐药基因。文献报道,CTX-M型基因在中国大陆地区所占比率为35.5%~93.6%,CTX-M型ESBLs检出率高于SHV和TEM[8-10]。近年来国内相关文献报道CTX-M-14、3、15占主导地位,也有其他基因型如CTX-M-13、12、24、1、22等散发报道[11-12]。本研究结果显示产ESBLs大肠埃希菌主要的耐药基因为CTX-M-9型(70.2%),而CTX-M-9型测序结果显示基因亚型为CTX-M-14,说明CTX-M-14型为本市产ESBLS大肠埃希菌流行基因,与国内相关文献报道相符。

参考文献
[1] 叶应妩, 王毓三. 全国临床检验操作规程[M]. 南京: 东南大学出版社, 1997: 1-621.
YE Y W, WANG Y S. National guide to clinical laboratory procedures[M]. Nanjing: Southeast University Press, 1997: 1-621.
[2] Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI).Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing[S]. 2014, M100-S24, 102-103.
[3] JEAN S S, HSUEH P R. High burden of antimicrobial resistance in Asia[J]. Int J Antimicrob Agents, 2011, 37(4): 291–295. DOI:10.1016/j.ijantimicag.2011.01.009
[4] 潘玫, 李稳, 王靖男, 等. 产CTX型超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌基因分析及耐药特征[J]. 山东大学学报(医学版), 2013, 51(11): 61–65.
PAN M, LI W, WANG J N, et al. Resistance and genotyping of producing CTX-type extended-spectrum β-Lactamase Escherichia coli isolates[J]. J Shandong Univ (Health Sci), 2013, 51(11): 61–65.
[5] 陈栎江, 吴庆, 徐春泉, 等. 大肠埃希菌超广谱β-内酰胺酶的基因分布和流行特性[J]. 中华传染病杂志, 2015, 33(2): 106–110.
CHEN L J, WU Q, XU C Q, et al. Investigation of distribution of drug resistant-related genes in Super-Broad-Spectrum β-Lactamases Producing Bacteria and its epidemiology[J]. Chin J Infect, 2015, 33(2): 106–110. DOI:10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2015.02.013
[6] 张晓丽, 张吉生, 斗章, 等. 产超广谱β-内酰胺酶细菌耐药性基因型分析[J]. 微生物学杂志, 2010, 30(1): 51–55.
ZHANG X L, ZHANG J S, DOU Z, et al. Genotype Analysis of Drug Resistance of Super-Broad-Spectrum β-Lactamases Producing Bacteria[J]. J Microbiol, 2010, 30(1): 51–55. DOI:10.3969/j.issn.1005-7021.2010.01.011
[7] 王喜仁, 王笑峰, 赵淑堂. 某院分离的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌ESBLs基因检测及分型[J]. 中国感染控制杂志, 2013, 12(5): 339–343.
WANG X R, WANG X F, ZHAO S T. Detection and genotyping of extended-spectrum β-lactamases in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from a hospital[J]. Chin J Infec Contl, 2013, 12(5): 339–343. DOI:10.3969/j.issn.1671-9638.2013.05.005
[8] BEDENIC B, GOIC-BARISIC I, BUDIMIR A, et al. Antimicrobial susceptibility and beta-lactamase production of selected gram-negative bacilli from two Croatian hospitals: MYSTIC study results[J]. J Chemother, 2010, 22(3): 147–152. DOI:10.1179/joc.2010.22.3.147
[9] PEIRANO G, COSTELLO M, PITOUT J D. Molecular characteristics of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli from the Chicago area: high prevalence of ST131 producing CTX-M-15 in community hospitals[J]. Int J Antimicrob Agents, 2010, 36(1): 19–23. DOI:10.1016/j.ijantimicag.2010.02.016
[10] LUO Y, YANG J, ZHANG Y, et al. Prevalence of β-lactamases and 16S rRNA methylase genes amongst clinical Klebsiella pneumoniae isolates carrying plasmid-mediated quinolone resistance determinants[J]. Int J Antimicrob Agents, 2011, 37(4): 352–355. DOI:10.1016/j.ijantimicag.2010.12.018
[11] 杨启文, 徐英春, 王辉, 等. CTX-M酶在北京协和医院临床分离大肠埃希菌中的流行[J]. 中国感染与化疗杂志, 2006, 6(1): 1–6.
YANG Q W, XU Y C, WANG H, et al. Prevalence of clinically isolated Escherichia coli producing CTX-M-type β-lactamases in Peking Union Medical College Hospital[J]. Chin J Infec Chemother, 2006, 6(1): 1–6. DOI:10.3321/j.issn:1009-7708.2006.01.001
[12] 苏丹虹, 卢鉴财, 卓超, 等. 广州地区大肠埃希菌与肺炎克雷伯菌CTX-M型产超广谱β-内酰胺酶基因分型的研究[J]. 中华医院感染学杂志, 2009, 19(22): 3004–3006.
SU D H, LU J C, ZHUO C, et al. Antibiotic Resistance of ESBLs-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Isolates with CTX-M Genotypes in Guangzhou: Analysis of Their Genotyping[J]. Chin J Nosocomiol, 2009, 19(22): 3004–3006. DOI:10.3321/j.issn:1005-4529.2009.22.002
http://dx.doi.org/10.16016/j.1000-5404.201708181
中国人民解放军总政治部、国家科技部及国家新闻出版署批准,
由第三军医大学主管、主办

文章信息

陈云芬, 董亚琼, 余俊, 陈芳.
CHEN Yunfen, DONG Yaqiong, YU Jun, CHEN Fang.
贵阳市多家医院感染产ESBLs大肠埃希菌基因分型研究
Genotyping of extended spectrum beta lactamases of 33 Escherichia coli strains from several hospitals of Guiyang City
第三军医大学学报, 2017, 39(24): 2396-2398
Journal of Third Military Medical University, 2017, 39(24): 2396-2398
http://dx.doi.org/10.16016/j.1000-5404.201708181

文章历史

收稿: 2017-08-27
修回: 2017-11-01

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